Вирусометрия

[Scyther]

Однажды утром Шерлок Холмс втащил меня в свою комнату и закрыл за собой дверь.

— Вы проснулись наконец и это как нельзя более кстати, мой дорогой Уотсон, — приветливо проговорил он.
— Я плохо спал ночью и боялся ночью вам помешать. Мне показалось, что вы заняты.
— Да, я занят. И даже очень. Уотсон, вы просматриваете по ночам в интернете сообщения с "bolshoyforum.com" раздел Наука, техника, технология (Модератор: Ost)?
— Конечно, Холмс.
...

Продолжение
...
   Однако я не слишком-то много извлек из данной мне Холмсом ссылки на материал. Одним словом, сколько я ни вчитывался в почти детективные описания и приключения "охотников за бивнями", но так и не смог в них увидеть ничего примечательного, за исключением того, что за Полярным кругом начала таять "вечная" мерзлота. Её гигантский холод стал уступать и выкидывать в наш современный мир реликтовые микроорганизмы и их генетический материал. Причем в череде последнего могли затесаться и те компоненты, которые несут угрозу для всего человечества. Совсем непонятным было описание каких-то гигантских популяций вирусов, которые восстали из дремлющих на Колыме.

   Весь дождливый и серый день я размышлял об этом материале, но к вечеру мой интерес совсем иссяк. И все же я пришел к выводу, что это дело – какой-то грандиозный розыгрыш или мошенничество, ведь я так и не смог уяснить смысла происходящего. Казалось, все же, совершенно неправдоподобным, что замороженный вирус может быть способным путешествовать вместе с бивнями по миру и порождать с невероятной скоростью то, что называется пандемией.

   На следующее утро я после завтрака снова зашел к знаменитому сыщику и застал его размышляющим в кресле.
    – Помните, мой дорогой Уотсон, мое вчерашнее замечание про сообщения с "bolshoyforum.com" раздел Наука, техника, технология (Модератор: Ost)? Это было как раз перед тем, как мы с Вами занялись несложной проблемой отделения кофейной гущи от того деликатного продукта, который затейливо готовит миссис Хадсон.
   – Конечно, Холмс. Тогда еще я оставил за собой право усомниться в её способностях.
   – Да, но, тем не менее, доктор, Вам придется принять мою точку зрения, ибо в противном случае, я буду заваливать Вас фактами до тех пор, пока Ваши убеждения не рухнут под их тяжестью, и Вы не признаете мою правоту. А вот Вам и новое сообщение, но теперь уже из русской газеты Коммерсант под заголовком "Китайские ученые опровергли версию происхождения COVID-19 на рынке Уханя".

   После Холмс начал рассказывать историю, которая обещала стать одной из самых необычных, которые я от него слышал. Тем более, что самые необычайные и уникальные случаи очень часто связаны не с большим, а с незначительным криминалом, а иногда и вовсе приходится сомневаться, был ли там криминал вообще. Из того, что я уже услышал, пока нельзя сказать является ли данный случай криминальным, или нет, но само развитие событий – безусловно, из числа самых незаурядных, которые мне когда-либо приходилось слышать. И я вынужден был признать, что приведенные факты, насколько я понимаю, - были действительно уникальны.

Китайские ученые опровергли версию происхождения COVID-19 на рынке Уханя
https://www.kommersant.ru/doc/4363782
Рынок морепродуктов в Ухане, считающийся очагом распространения барановируса, был, скорее, жертвой COVID-19, а не его причиной, сообщило издание Daily Mail со ссылкой на результаты исследования ученых Китайского национального центра по профилактике и контролю заболеваний.

[Scyther]

Китайские ученые опровергли версию происхождения COVID-19 на рынке Уханя
https://www.kommersant.ru/doc/4363782
Рынок морепродуктов в Ухане, считающийся очагом распространения барановируса, был, скорее, жертвой COVID-19, а не его причиной, сообщило издание Daily Mail со ссылкой на результаты исследования ученых Китайского национального центра по профилактике и контролю заболеваний.

Согласно приводимому изданием исследованию, генетические данные подтверждают, что вирус возник у китайских летучих мышей, но точное место, где он перешел от них к людям, неизвестно. Ученые полагают, что передача вируса была через «промежуточное животное», которое также пока не установлено.

По мнению ученых, местный рынок стал «суперраспространителем», но не местом создания. Согласно проведенным исследованиям, все образцы проданных на рынке животных дали отрицательный результат на COVID-19, то есть они не могли заразить покупателей. «Теперь выясняется, что рынок является одной из жертв»,— цитирует издание слова директора научного центра Гао Фу.

[Scyther]

Аппроксимация развития пандемии барановируса в России.

Таблица. Количество зараженных в РФ. Исходные данные на 03.06.20 от
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries

• Дата   Общее число зараженных (чел.)
• 08 мая 2020 - 183466 ->  за сутки +10787  (187859 ->  за сутки +10699)
• 09 мая 2020 - 194473 ->  за сутки +11007  (198676 ->  за сутки +10817)
• 10 мая 2020 - 205652 ->  за сутки +11178  (209688 ->  за сутки +11012)
• 11 мая 2020 - 216950 ->  за сутки +11298  (221344 ->  за сутки +11656)
• 12 мая 2020 - 228314 ->  за сутки +11365  (232243 ->  за сутки +10899)
• 13 мая 2020 - 239690 ->  за сутки +11376  (242271 ->  за сутки +10028)
• 14 мая 2020 - 251022 ->  за сутки +11332  (252245 ->  за сутки +9974)
• 15 мая 2020 - 262255 ->  за сутки +11233  (262843 ->  за сутки +10598)
• 16 мая 2020 - 273338 ->  за сутки +11082  (272043 ->  за сутки +9200)
• 17 мая 2020 - 284219 ->  за сутки +10882  (281752 ->  за сутки +9709)
• 18 мая 2020 - 294855 ->  за сутки +10635  (290678 ->  за сутки +8926)
• 19 мая 2020 - 305202 ->  за сутки +10347  (299941 ->  за сутки +9263)
• 20 мая 2020 - 315224 ->  за сутки +10022  (308705 ->  за сутки +8764)
• 21 мая 2020 - 324890 ->  за сутки +9666  (317554 ->  за сутки +8849)
• 22 мая 2020 - 334174 ->  за сутки +9284  (326448 ->  за сутки +8894)
• 23 мая 2020 - 343056 ->  за сутки +8882  (335882 ->  за сутки +9434)
• 24 мая 2020 - 351521 ->  за сутки +8465  (344481 ->  за сутки +8599)
• 25 мая 2020 - 359560 ->  за сутки +8038  (353427 ->  за сутки +8946)
• 26 мая 2020 - 367167 ->  за сутки +7607  (362342 ->  за сутки +8915)
• 27 мая 2020 - 374342 ->  за сутки +7176  (370680 ->  за сутки +8338)
• 28 мая 2020 - 381090 ->  за сутки +6748  (379051 ->  за сутки +8371)
• 29 мая 2020 - 387417 ->  за сутки +6327  (387623 ->  за сутки +8572)
• 30 мая 2020 - 393334 ->  за сутки +5917  (396575 ->  за сутки +8952)
• 31 мая 2020 - 398853 ->  за сутки +5519  (405843 ->  за сутки +9268)
• 01 июня 2020 - 403988 ->  за сутки +5136  (414328 ->  за сутки +8485)
• 02 июня 2020 - 408757 ->  за сутки +4769  (423186 ->  за сутки +8858)
• 03 июня 2020 - 413176 ->  за сутки +4419
• 04 июня 2020 - 417262 ->  за сутки +4087
• 05 июня 2020 - 421035 ->  за сутки +3773
• 06 июня 2020 - 424513 ->  за сутки +3478
• 07 июня 2020 - 427714 ->  за сутки +3201
• 08 июня 2020 - 430656 ->  за сутки +2942
• 09 июня 2020 - 433357 ->  за сутки +2701
• 10 июня 2020 - 435833 ->  за сутки +2476

Согласно аппроксимации:
Точка перегиба - 13 мая 2020 (выделена жирным).
В этот день (13.05.20) максимальное количество вновь заразившихся - 11376 человек.
Общее число заразившихся на 13.05.20 - 239690.
Общее число всех зараженных в РФ  - 479380 человек.

Барановирус в России.
Картинки на 03.06.20 (синий цвет - аппроксимация, точки - ежедневные отметки)



Замечания:
- В перечне после стрелки - количество новых случаев.
- В скобках указаны фактические значения и фактическое число новых случаев.

[Scyther]

Аппроксимация числа переболевших COVID-19 в России.

Таблица. Количество переболевших (официально учтенных!) в РФ на 03.06.20

• Дата   Общее число переболевших COVID-19 (чел.)
• 20 мая 2020 - 86020 ->  за сутки +6746  (85392 ->  за сутки +9262)
• 21 мая 2020 - 93076 ->  за сутки +7056  (92681 ->  за сутки +7289)
• 22 мая 2020 - 100413 ->  за сутки +7337  (99825 ->  за сутки +7144)
• 23 мая 2020 - 107996 ->  за сутки +7583  (107936 ->  за сутки +8111)
• 24 мая 2020 - 115785 ->  за сутки +7789  (113299 ->  за сутки +5363)
• 25 мая 2020 - 123735 ->  за сутки +7950  (118798 ->  за сутки +5499)
• 26 мая 2020 - 131796 ->  за сутки +8061  (131129 ->  за сутки +12331)
• 27 мая 2020 - 139916 ->  за сутки +8120  (142208 ->  за сутки +11079)
• 28 мая 2020 - 148040 ->  за сутки +8125  (150993 ->  за сутки +8785)
• 29 мая 2020 - 156116 ->  за сутки +8075  (159257 ->  за сутки +8264)
• 30 мая 2020 - 164089 ->  за сутки +7973  (167469 ->  за сутки +8212)
• 31 мая 2020 - 171910 ->  за сутки +7821  (171883 ->  за сутки +4414)
• 01 июня 2020 - 179533 ->  за сутки +7623  (175514 ->  за сутки +3631)
• 02 июня 2020 - 186916 ->  за сутки +7383  (186602 ->  за сутки +11088)
• 03 июня 2020 - 194024 ->  за сутки +7108
• 04 июня 2020 - 200827 ->  за сутки +6803
• 05 июня 2020 - 207302 ->  за сутки +6475
• 06 июня 2020 - 213432 ->  за сутки +6130
• 07 июня 2020 - 219206 ->  за сутки +5774
• 08 июня 2020 - 224619 ->  за сутки +5413
• 09 июня 2020 - 229671 ->  за сутки +5052
• 10 июня 2020 - 234367 ->  за сутки +4696

Согласно аппроксимации:
Точка перегиба - 28 мая 2020 (выделена жирным).
В этот день (28.05.20) максимальный прирост переболевших - 8125 человек.
Общее число переболевших на 28.05.20 - 148040 человек.

Барановирус в России.
Картинки на 03.06.20 (синий цвет - аппроксимация, точки - ежедневные отметки)




Аппроксимация показывает, что сдвиг между пиками прироста зараженных и переболевших составляет 15 дней.

Замечания:
- В перечне после стрелки - количество новых случаев выздоровления.
- В скобках указаны фактические значения и фактическое число новых случаев выздоровления.

[Scyther]

Кто заказывал такси на Дубровку?


https://youtu.be/ydlih21MsZc

Затопив мост, наводнение отрезало от мира три деревни (от 3 июня 2020)
https://obninsk.name/news25319.htm
...Сейчас в трёх деревнях под Малоярославцем отрезаны от цивилизации не только полторы сотни местных жителей, но беженцы от барановируса из Москвы, дачники...



https://youtu.be/-N_ZW86RLkw

[Scyther]

Образовался российский штамм барановируса
https://www.mk.ru/science/2020/06/04/obrazovalsya-rossiyskiy-shtamm-koronavirusa.html



Ученые прокомментировали версию о самоликвидации COVID-19

Два главврача из Италии, Альберто Зангрильо (больница Сан-Раффаэле в Милане) и Маттео Бассетти (клиника инфекционных заболеваний больницы Сан-Мартино в Генуе) выступили с сенсационным заявлением: барановирус, который ходит по их стране, точнее, по их больницам, утратил агрессивные свойства и больше болеть им не опасно. Мы опросили известных экспертов в области вирусологии и инфекционных заболеваний, возможны ли столь быстрые мутации вируса и действительно ли жизнь налаживается.

Основанием для громких заявлений итальянских врачей стали результаты исследований мазков (ПЦР-диагностики) пациентов за последние 10 дней, который показали, что вирусная нагрузка в них «бесконечно мала» по сравнению с тестами, которые выполнялись лишь месяц назад. "Барановирус в Италии клинически больше не существует", - заявил профессор Зангрильо. А его коллега из Генуи подтвердил, что вирус уж не тот, и нынешние пациенты болеют гораздо легче.

Возможно ли "самоуничтожение" вируса?
Обозреватель "МК" спросил об этом экспертов.

Как рассказал нам доцент кафедры инфекционных болезней ПФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова Иван Коновалов, у нового барановируса выявлено уже гигантское количество генетических модификаций:
"Идет постоянное структурное изменение, это характерно для любых вирусов, однако говорить об изменении его биологических свойств пока рано. Многочисленными исследованиями уже показано, что принципиальная структура антигенов нового барановируса не меняется так быстро, как, например, у вируса гриппа типа А.
Поэтому заявления о том, что COVID-19 резко потерял вирулентность, требуют подтверждений. Во всем мире сегодня идет большая работа по наблюдению за вирусом, параллельно проводится постоянная лабораторная диагностика COVID-19, его расшифровка. Есть специальный веб-сайт, где публикуют все выявленные изменения генома  вируса, их на данный момент несколько тысяч.
И, конечно, утверждать что-либо относительно агрессии или ослабевания вируса можно только тогда, когда мы получим такие результаты не в мазках людей в конкретной клинике, а когда всеобщие показатели заболеваемости и летальности будут принципиально уменьшаться"

- Ученые заявляли, что лабораторно выделены как агрессивные, так и менее агрессивные штаммы вируса, всего их четыре. Якобы азиатские менее агрессивные, а вот итальянский – самый суровый. Может, дело в штаммах?

- Да, действительно, разные штаммы обладают разной вирулентностью и патогенностью. Но необходимо понимать, что, помимо лабораторных условий, где выявляют свойства вирусов в плане заражения клеток и их агрессии относительно клеточных культур, есть условия человеческого организма, который гораздо сложнее, чем любая биологическая модель. И попытки сравнивать вирулентность в лабораторных условиях не всегда показывают результативность на уровне реальной клинической картины.

Все зависит не от того, какой вирус, а от того, кто болеет, от генетических особенностей человека. Вирусная теория разнообразия соседствует с анализом расовых и социальных особенностей в структуре летальности, который проводят, например, в США.

[Scyther]

Образовался российский штамм барановируса (Продолжение)
https://www.mk.ru/science/2020/06/04/obrazovalsya-rossiyskiy-shtamm-koronavirusa.html



Ученые прокомментировали версию о самоликвидации COVID-19

- А что, кстати, показал расовый анализ? Выявлены расы или этносы, которые страдают от вируса больше?

- Наибольший процент поражения выявлен среди латиноамериканцев, затем идет негроидная, и лишь потом европеоидная расы. Но и это не отражает всей картины! Мы должны понимать, что социальные условия жизни людей разные, и это играет огромную роль.

- Видела исследования, которые показали, что вне зависимости от агрессивности штамма, тяжелее болеют люди с отягощенным анамнезом, а легче – относительно здоровые…

- Генетика в данном случае подразумевает и врожденные особенности, варианты аллелей в генетическом коде человека, который реализуется в условиях среды, в которой он растет и развивается, то есть, какое он получает питание, воспитание, какой у него род деятельности, каковы условия проживания, с какими инфекциями он встречался. Есть немало исследований, когда люди с определенным набором генов более расположены к инфицированию, а другие менее. 

Пока привязка инфицирования к конкретным генам отсутствует, но это предмет разбирательств в будущем, который определит возможности скрининга. Болезнь острая, всем генетический анализ делать невозможно. Свойства вируса важны, хотя они динамически меняются, и они имеют схожие характеристики.

В Россию вирус попал из Европы, причем тот вариант, который обнаружили сначала в Иране – считается, что он более агрессивный, чем «китайский».

Но сейчас невозможно говорить о чисто иранском, итальянском или китайском штамме, у нас уже несколько ветвей российского, он уже наш собственный. Расшифровкой заниматься необходимо, а Россия – не из  самых передовых стран в плане объемов генетической расшифровки. Пока мы наблюдаем за вирусом в режиме реального времени и  фиксируем данные. Объективная картина может быть описана только по истечении времени, анализа материала.

Директор Института медицинской паразитологии, тропических и трансмиссивных заболеваний им. Е.И. Марциновского Сеченовского университета Александр Лукашев рассказал "МК", что тоже не стал бы торопиться с выводами по поводу снижения агрессивности вируса.

"Эти выводы были сделаны на основании того, сколько было обнаружено в мазках из носоглотки нуклеиновой кислоты. Связь этого показателя с тяжестью заболевания не была доказана, и они не обязаны коррелировать. Потому что самая тяжелая форма заболевания связана с размножением вируса в легких, а анализ проводится по мазкам из носа и ротовой полости. Но известно, что вирус может размножаться в одном месте, и при этом отсутствовать в другом. Кроме того, количество вируса в мазке из ротоглотки зависит и от техники забора мазка, и от условий транспортировки, и от стадии заболевания, и от многих других факторов.


Замечание Scyther-a: Достаточно странная логика в последнем заявлении, однако. Ведь если признано, что сущность вирусного заболевания - это цепная реакция самотиражирования вируса, тогда стадия (тяжесть!) заболевания напрямую связана с уровнем заражения, то есть с концентрацией нуклеиновой кислоты в мазках. Откуда взят мазок важно лишь при сравнении тяжести заболевания различных пациентов.

[Scyther]

Образовался российский штамм барановируса (Окончание)
https://www.mk.ru/science/2020/06/04/obrazovalsya-rossiyskiy-shtamm-koronavirusa.html



Ученые прокомментировали версию о самоликвидации COVID-19

- Но они сравнивали с такими же анализами, взятыми месяц назад…

- В любом случае, это совершенно не тот показатель, который измеряют, чтобы делать выводы. Если исследуется кровь, то там что-то можно измерить. А в мазке не берут фиксированный объем, и ты не знаешь, сколько на зонд попало биоматериала: в двух анализах количество биологического материала может различаться в разы. С кровью такого не бывает, с мочой тоже, а с мазками запросто.

Этот показатель и так-то не отражает тяжесть заболевания, к тому же он очень сильно варьируется. А чтобы говорить, что вирус ослаб, нужна статистика очень высокого качества. В Италии на ранних этапах развития эпидемии большая часть легких случаев не фиксировалась. Сейчас эпидемия идет на спад. Появилась возможность обследовать легких больных, и это еще один фактор, почему может обнаруживаться меньше вируса. Делать глобальные выводы на основании столь ненадежных данных совершенно невозможно.

Но вирус действительно может мутировать, причем, может мутировать в любую сторону. Более вероятны благоприятные для нас мутации снижения патогенности, хотя принципиально возможны и другие. Однако чтобы новый мутировавший вирус распространился по всему миру, должна сначала где-то произойти мутация, после которой новый вирус должен вытеснить старый по всему миру. Мутирует он в одной точке, у одного больного, а дальше распространяется на миллионы. Смена свойств вируса в глобальном масштабе - процесс длительный, который занимает месяцы и годы, но никак не недели.

- Есть ли примеры мировых пандемий с такими глобальными изменениями вируса?

Хрестоматийный пример – вирус миксомы кроликов. Этот вирус, смертельно опасный для кроликов, внесли в Австралии, чтобы уменьшить их популяцию. И за несколько лет он стал значительно менее патогенным, а кролики обрели к нему устойчивость. Правда, до этого 90% из них умерли. А теперь ничего, приспособились друг к другу и нормально сосуществуют.

Замечание Scyther-a: Замечательное утверждение:
Этот показатель и так-то не отражает тяжесть заболевания
Вот те на! Совсем непонятно о тяжести какого заболевания рассуждает специалист? Если вирусного, то единственным показателем того, что называется тяжестью может и должна служить концентрация вируса в мазке. Именно из этого исходит система тестирования и это является её основой.

[Scyther]

Трамп заявил о необходимости снять ограничения из-за COVID-19 в США
https://www.pravda.ru/news/world/1504361-Tramp/



Президент США Дональд Трамп заявил, что страна уже готова к отмене ограничений, введенных из-за COVID-19.
"Мы открываем нашу страну. И я не понимаю, почему некоторые губернаторы продолжают сохранять санитарные ограничения", — заявил он. Американский лидер считает, что в США уже пройден пик эпидемии.


Ситуация в США сегодня мало чем отличается от той, что была месяц, да и два назад. Это следует из данных о зараженных барановирусом от 06.06.2020. Всё те же ежедневные свыше 20 тысяч зараженных.
Но, видимо, нынче это уже зараженные совсем другого сорта.

[Scyther]

Названы главные разносчики барановируса
https://lenta.ru/news/2020/06/08/super/



Основным способом распространения барановирусной инфекции названы суперраспространители — зараженные, которые передали COVID-19 большому числу людей. Об этом пишет Business Insider.

Гонконгские ученые изучили ситуацию с распространением инфекции и заключили, что 70 процентов зараженных вообще не передают инфекцию. При этом 80 процентов случаев заражения происходит по вине 20 процентов носителей. По словам специалистов, они стали главными разносчиками инфекции.

«Суперраспространители появляются чаще, чем мы ожидали, и теперь это нельзя считать случайностью. Частота суперраспространения выходит за пределы того, что мы могли вообразить, — заявил соавтор исследования Бен Коулинг. — Если мы сможем остановить суперраспространение, это пойдет на пользу всем людям».

Ученые проанализировали более тысячи случаев заражения барановирусом в Гонконге с конца января по конец апреля. Из них около 350 возникло в результате распространения представителями одной группы, а остальные были ввезены из-за рубежа. Зафиксировано шесть случаев суперраспространения, которые повлияли на более чем половину случаев заражения внутри сообществ.

[Scyther]

Как ни странно это звучит, но в такой интерпретации модельной Жертвой можно полагать так называемых БЕССИМПТОМНЫХ ЗАРАЖЕННЫХ.

В возможности заражения барановирусом от бессимптомных носителей усомнились
https://lenta.ru/news/2020/06/09/corona_study/



Бессимптомные носители барановируса крайне редко заражают других людей. Об этом сообщает «Би-би-си» со ссылкой на эксперта Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) Марию Ван Керкхов.

Эпидемиолог рассказала, что ученые сомневаются в возможности передачи вируса от зараженных, у которых заболевание протекает без симптомов, здоровым людям. По ее мнению, наиболее заразны именно больные с ярко выраженными симптомами.

Специалист ссылается на информацию ВОЗ, полученную из ряда стран с системами отслеживания контактов зараженных. Тем не менее вопрос о возможности экстраполяции этих данных на другие государства остается открытым.

Многие эксперты выразили сомнения в утверждении Ван Керкхов, так как она не предоставила подробной информации о статистике, на основе которой сделала свои выводы. Они также указали на то, что подобные заявления могут негативно сказаться на борьбе с распространением заболевания и повлечь за собой преждевременное снятие ограничительных мер.

Ранее Ван Керкхов опровергла распространенную теорию о том, что барановирус со временем мутирует и становится все более опасным. Она рассказала, что вирус изменяется в пределах нормы, которая характерна для подобных ему заболеваний, например, гриппа.

[Scyther]

Данные об активных пациентах в некоторых странах мира на 12 июня 2020 года

Пасьянс из картинок.



Замечание: Количество активных пациентов позволяет судить о степени загруженности систем здравоохранения различных стран, а также отличать различные страны по режиму (стадии) пандемии. Например, видно, что система здравоохранения Англии загружена почти также, как и Минздрав РФ, несмотря на почти трехкратную разницу в численности населения.

[Scyther]

Аппроксимация данных о количестве активных пациентов

На основе имеющихся данных (на 14 июня) получено аналитическое выражение, позволяющее аппроксимировать временную зависимость числа активных пациентов в некоторых европейских странах (Германия, Дания, Финляндия и Италия), в которых произошли существенные изменения - пандемия явно отступает и пик активных пациентов преодолен:



Использование того же выражения для стран, которые еще не преодолели тот же пик, позволяет получить показанную ниже аппроксимацию количества активных пациентов в России, Белоруссии, Англии и США.



Как следует из аппроксимации, снижение активных пациентов в РФ
до 150 тысяч произойдет к 1 июля, а до 50 тысяч - к 1 сентября.

[Scyther]

Аппроксимация количества активных пациентов, находящихся под наблюдением врачей в РФ на 14 июня 2020 года

Количество активных пациентов равно числу граждан, зараженных барановирусом,  из которого исключены переболевшие и погибшие. Ниже представлены данные о числе активных пациентов, а также об их ежедневном приросте (положительные значения) или снижении (отрицательные значения).

[Scyther]

Аппроксимация количества активных пациентов, находящихся под наблюдением врачей в РФ на 16 июня 2020 года

Количество активных пациентов равно числу граждан, зараженных барановирусом,  из которого исключены переболевшие и погибшие. Ниже представлены данные о числе активных пациентов, а также об их ежедневном приросте (положительные значения) или снижении (отрицательные значения).



В качестве шаблонной функции аппроксимации данных в РФ взята та, которая удовлетворительно описывает данные о количестве активных пациентов в Германии.

Ситуация с активными пациентами в Германии на 16 июня.



Замечание: Из последнего графика видно, что пилообразные реальные данные слишком изменчивы для того, чтобы их можно было бы даже вообразить в виде какой-либо гладкой кривой. Однако синяя линия задана в виде очень простой аналитической функции.

[Scyther]

Специалисты заподозрили неладное: вторая волна барановируса пришла в Пекин гораздо раньше
https://www.mk.ru/science/2020/06/18/specialisty-zapodozrili-neladnoe-vtoraya-volna-koronavirusa-prishla-v-pekin-gorazdo-ranshe.html



Власти китайской столицы случайно узнали о «контратаке» COVID-19

С Китая начался барановирус, и там же с ним смогли быстрее всего справиться. Впрочем, стоит отметить, что зимой-весной власти Поднебесной сумели удержать эпидемию в рамках провинции Хубей, не допустив массовых случаев заражения барановирусом в остальной части страны. В Пекине за все время пандемии заразилось менее 500 человек. Однако на днях пришли тревожные новости – в китайской столице заболело еще 100 человек. Причем, по уверениям больных, они никуда не выезжали из города: значит, барановирус мог «гулять» по Пекину уже некоторое время. Специалисты предполагают, что новый кластер COVID в столице мог появиться еще весной.

Еще несколько недель назад казалось, что в большей части Пекина жизнь вернулась в нормальное русло. Рестораны приветствовали посетителей, люди возвращались на работу, вновь открывались школы. Пандемия казалась пройденным этапом.

Поэтому в стране произошел шок, когда Пекин объявил о первом за 55 дней случае заражения барановирусом внутри страны. Заболевшим оказался 52-летний мужчина по фамилии Тан, не покидавший Пекин более двух недель и не контактировал ни с кем за пределами города. Это могло значить только одно – где-то в столице есть люди, которые болеют барановирусом, и про них ничего не известно властям.

Китайские власти занялись поисками тех, кто переносит болезнь. Вскоре они обнаружили еще несколько десятков случаев. В основном, все эти случаи были связаны с рынком «Синьфади» на юго-востоке Пекина.

Впрочем, власть пытается быстро среагировать на угрозу и не допустить распространения барановируса. Через два дня после первого заражения в некоторых районах Пекина были вновь введены строгие меры по предотвращению второй волны инфекции.

На данный момент число случаев заражения барановирусом в Пекине остается небольшим для города с населением в 22 миллиона человек. Но власти принципиально не желают рисковать: в среду было отменено 1200 рейсов в два пекинских аэропорта и обратно. Школы вновь закрылись – всего через месяц после открытия. С тех пор как было объявлено о первом случае заражения, было проверено более 3,5 миллионов человек.

В Пекине власти в четверг распорядились закрыть все отели, а также рестораны в районах повышенного риска. При этом чиновники заявляют, что Пекин не заблокирован, но призвали всех жителей по возможности никуда не ездить и не собираться без необходимости, со своей стороны, обязавшись обеспечить бесперебойное снабжение продовольствием.

Как заявил в четверг главный эпидемиолог Китайского центра по профилактике и контролю заболеваний У Цзунью, эпидемическая ситуация в Пекине находится под контролем, и число новых выявленных случаев, как ожидается, снизится в течение ближайших нескольких дней. При этом, по словам У Цзунью, хотя в столице ежедневно регистрируются новые подтвержденные случаи заболевания COVID-19, не означает, что все случаи - это новые инфицированные.

[Scyther]

Специалисты заподозрили неладное: вторая волна барановируса пришла в Пекин гораздо раньше (Окончание)
https://www.mk.ru/science/2020/06/18/specialisty-zapodozrili-neladnoe-vtoraya-volna-koronavirusa-prishla-v-pekin-gorazdo-ranshe.html



Власти китайской столицы случайно узнали о «контратаке» COVID-19
...
Однако новые случаи заболевания в Пекине вызывают тревожные вопросы. Причем эти вопросы не только о том, как вирус мог попасть на рынок «Синьфади», но и о том, является ли домашний скот или даже рыба переносчиками вируса. Китайские чиновники предположили, что вирус мог циркулировать на рынке с апреля. Это еще больше осложняет дело – в такой ситуации очень тяжело отследить тот момент, когда в реальности началась новая вспышка.

По словам директора Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний Гао Фу, совокупность новых случаев заболевания барановирусом в Пекине могла возникнуть на месяц раньше, чем предполагалось, отчасти это могло произойти из-за бессимптомных инфекций.

Гао Фу считает, что на фоне жестких ограничений, препятствующих распространению столичного кластера, который в настоящее время насчитывает более 150 случаев, новая вспышка произошла не в начале июня или в конце мая, но, вероятно, месяцем ранее, сообщают китайские государственные СМИ.

Хотя, по мнению Гао, что возникновение новой вспышки частично могло быть связано с бессимптомными случаями, необходимо провести дальнейшее расследование.

Печальной иронией выглядит тот факт, что за несколько недель до этой вспышки китайские чиновники с гордостью говорили о своих успехах в сдерживании барановируса, предполагая, что Китай может стать образцом для подражания для других. Но новые случаи заражения в Пекине показывают, что ситуация может быть гораздо более хрупкой, чем кажется.

Возможно, ситуация была бы еще хуже – если бы не бдительность простого китайца по фамилии Тан, который решил поехать в центр тестирования, почувствовав только легкие симптомы. Именно его случай стал сигналом для властей, что в городе начинается новая вспышка. Если бы он отнесся к болезни как к обычной простуде, вирус бы продолжал незаметно расползаться по одному из крупнейших городов Азии.

Возможно, именно бдительность простого китайского мужчины спасет мир от второй волны барановируса.

[Scyther]

Уровень заражения COVID-19 может быть в 80 раз выше, чем считалось
https://hightech.fm/2020/06/23/covid-19-infection-rate



Эпидемиологи из университет штата Пенсильвания считают, что первоначальный уровень инфекции COVID-19 был недооценен из-за проблем с тестированием бессимптомных и альтернативно симптоматических лиц, а также из-за невозможности идентифицировать ранние случаи. Новое исследование опубликовано в журнале Science.

Исследователи оценили частоту выявления симптоматических случаев COVID-19 в США за март этого года. Они взяли данные центров по контролю и профилактике заболеваний. По результатам выяснилось, что первоначальные оценки распространения вируса были сильно занижены.

Джастин Сильверман, доцент в Колледже информационных наук и технологий, медицинского факультета Пеннского штата:
Мы проанализировали случаи ГПЗ (гриппоподобных заболеваний) в каждом штате, чтобы оценить число случаев, которые нельзя отнести к гриппу и которые превышают сезонные исходные уровни. Когда вы вычитаете их, у вас остается то, что мы называем избытком ГПЗ — это случаи, которые нельзя объяснить ни гриппом, ни типичным сезонным изменением респираторных патогенов.


Размер наблюдаемого всплеска избыточного ГПЗ соответствует 8,7 миллионам новых случаев в течение последних трех недель марта. Для сравнения, официально было зарегистрировано примерно 100 000 случаев в аналогичный период времени.

Исследователи также использовали этот процесс для оценки уровня инфицирования в каждом штате. Они отметили, что в штатах, где уровень инфицирования на душу населения был выше, отмечалось увеличение избыточной ГПЗ. Первоначальные оценки были весьма ниже реальной картины. Ситуация выровнялась после того, как государства начали завершать тестирование на антитела.

По словам Сильвермана, результаты показывают, что серьезные последствия от COVID-19 связаны не только с его летальностью, сколько с тем, насколько быстро он смог распространиться в сообществах на начальном этапе.

Замечание: Отрадно, что в вирусологии начинают отличать заболеваемость от инфицирования, как в других науках принято полагать причиной воздействие на систему, а следствием - её отклик.

[Scyther]

Ученые выяснили, сколько барановирус живет в реках и озерах
https://hightech.fm/2020/06/22/summer-covid



Европейские ученые проследили поведение барановируса нового типа при попадании в воду. Кроме того, исследователи оценили опасность употребления неочищенной воды в двух десятках стран. Выяснилось, что в реках и озерах вирус может находиться до 25 дней. Предварительные результаты исследования ученых опубликованы в электронной научной библиотеке medRxiv.

После вспышки тяжелого острого респираторного синдрома барановируса (SARS-CoV-2) в Китае воздушно-капельный путь передачи вируса был определен в качестве основного. Но и другие пути передачи, вероятно, существуют. Исследователи количественно оценили выживаемость вируса SARS-CoV-2 в воде, а также и риск заражения фекально-загрязненной водой в 39 странах.

В результате ученыеустановили, что вирус может оставаться стабильным в воде до 25 дней. При этом, риск заражения фекальными водами в конкретной стране зависит от окружающей среды. Загрязненные фекалиями реки, водные пути и водные системы в странах с высоким уровнем инфицирования могут обеспечить инфекционные дозы в количестве более 100 копий вируса на 100 мл воды.

Исследовательская группа ученых из Британии и Польши:
«Природные водоемы могут служить резервуарами и путями распространения для барановируса нового типа (SARS-CoV-2). Во многих странах они представляют собой реальную угрозу для здоровья, и поэтому если недавно происходили утечки из канализации, то контакты людей и животных с речными и озерными водами нужно минимизировать»

Почему же вирус так опасен в воде?

Барановирус нового типа поражает не только клетки легких, он распространяется на другие ткани тела — слизистой оболочки носа, пищевода, сосудов и сердца, и не только. Поэтому в отходах жизнедеятельности человека медики находят так много вирусных частиц. И именно с отходами вирус оказывается в сточных водах и канализации.

Результаты исследований медиков из Италии и Испании демонстрируют до попадания в водоемы современные системы очистки сточных вод, по идее, должны полностью нейтрализовать барановирус.

Но группа эпидемиологов под руководством доцента Эксетерского университета (Великобритания), Джейми Шатлера, задумалась над последствиями попадания части зараженных канализационных вод попадает в водоемы до очистки.

Итак, исследователи попытались понять, как долго частицы SARS-CoV-2 могут находиться в воде. Кроме того, важно было понять, как долго вирус сохраняет способность заражать новых жертв.

После серии экспериментов выяснилось, что вирус может находиться в воде очень долгое время, если ее температура будет достаточно низкой. В типичных канализационных стоках, а также водах рек и озер вирус живет около 25 дней.

Учитывая то, что вирус остается стабильным в очень большом диапазоне pH при низких температурах, вполне возможно и то, что он будет выживать и в водах морей и океанов. Рецепторы ACE2 у многих видов китообразных очень похожи на их человеческий аналог, поэтому они могут быть уязвимы для SARS-CoV-2. Особенное беспокойство вызывают в этом отношении киты, так как через их горло постоянно проходят большие объемы воды.

[Scyther]

Посмотрите, какие органы барановирус атакует первыми и как это происходит
https://hightech.fm/2020/06/22/covid-destroy



Чтобы изучить, как новый барановирус разрушает организм, ученые выращивают миниатюрные органы в лаборатории. Исследования этих органоидов выявляют универсальность вируса при проникновении в легкие, печень, почки и кишечник. Ученые также экспериментируют с лекарствами в этих мини-тканях, чтобы выяснить, могут ли такие методы лечения быть подходящими для лечения людей. Исследование опубликовано в научной электронной библиотеке bioRxiv.

После тысяч госпитализированных пациентов и вскрытий после летальных случаев врачи знают, что SARS-CoV-2 может оказать разрушительное воздействие на органы. Но пока не ясно, вызван ли этот ущерб непосредственно вирусом или вторичными осложнениями инфекции.

Ученые для своих исследований используют органоиды — искусственные мини-органы, чтобы показать, куда в организме распространяется вирус, какие клетки он заражает и какой вред наносит.

Томас Эфферт, клеточный биолог из Университета Йоханнеса Гутенберга:
Вся прелесть органоидов в том, что они напоминают истинную морфологию тканей.

Вирусологи обычно изучают вирусы, используя клеточные линии или клетки животных, культивируемые в чашке Петри. Но они не моделируют инфекцию SARS-CoV-2 достаточно хорошо по одной причине. Клетки из чашки не покажут, что происходит в теле при заражении, говорят исследователи.

Органоиды лучше демонстрируют, что SARS-CoV-2 делает с тканями человека, говорит Нурия Монтсеррат, биолог стволовых клеток в Институте биоинженерии Каталонии в Барселоне, Испания. По словам Монтсеррат, их можно выращивать так, чтобы они включали клетки разных типов и могли принимать форму оригинального органа в течение нескольких недель. Кроме того, они дешевле, чем модели животных. Также использование органоидов более этично.

И все же исследования SARS-CoV-2 в органоидах имеют ограничения. Они не отражают перекрестные помехи между органами, которые происходят в организме. Это значит, что результаты все еще должны быть подтверждены на животных моделях и в клинических исследованиях, говорит Барт Хаагманс, вирусолог в Erasmus MC в Роттердаме, Нидерланды.

Эксперимент с органоидами наглядно показал, что SARS-CoV-2 делает с клетками дыхательной системы, от верхних дыхательных путей до легких.

Кадзуо Такаяма, биолог стволовых клеток в Университете Киото, Япония, и его коллеги разработали органоиды бронхов с четырьмя различными типами клеток. Когда его команда заразила их SARS-CoV-2, они обнаружили, что вирус в основном нацелен на стволовые клетки. Теперь исследователи планируют изучить, может ли вирус распространяться от базальных к другим клеткам.