Проходит еще десять лет. Попытки Стоуна на посту ЕС объединить мир и покончить с войнами и голодом приводят к созданию Объединенного Всемирного Союза, к которому примкнули ООН, ЕС, социалистические страны, а также страны третьего мира. В оппозиции остались лишь несколько стран, среди которых были две крупные державы – США и Китай. Стоун Александр становится канцлером ОВС. Его цели достигают финальной прямой. Следуя его замыслу, понятие государства упразднено, а весь мир поделен на десять демократических зон. Одна валюта, один язык, одна цель и… один диктатор. В то же самое время именно Стоун устраняет со своего пути мудрого президента США Ричарда Бенсона (Р. Ли Эрми), давая, таким образом, возможность занять этот пост вице-президенту Дэвиду Александру. А вскоре Дэвида избирают президентом Северо-Американской зоны.

К этому времени некоторым становятся ясны истинные мотивы Стоуна Александра. На Землю обрушиваются непрекращающиеся стихии, наводнения, опустошительные рои саранчи, постоянный метеоритный дождь сыплется на планету. Это тривиальная борьба за власть – но не просто за власть, а за то, чтобы занять трон Бога. Сам же он есть не кто иной, как Повелитель, живущий на Земле в разных телах уже несколько тысяч лет. Ему помогают слуги – преданные люди, его ангел-хранитель (Удо Кьер) и ужасные звери, сотканные из Тьмы. С их помощью Стоун убирал со своего пути каждого, кто хоть не много ему мешал. А теперь ему осталась последний шаг – поставить на колени всё человечество. Место действия – древний город Мегиддо, который тысячелетия назад назывался Армагеддоном. Именно здесь Стоун решил поставить точку в своей миссии, раскрыв небеса для слуг Тьмы. Земля должна была стать раем для падших ангелов, но антипод Стоуна – его брат Дэвид – вместе с китайским премьером под видом присоединения своих армий к Стоуну, неожиданно напали на него. В разразившемся сражении Стоун перед союзниками полностью раскрыл свои дьявольские замыслы и в итоге проиграл битву в долине Мегиддо.
Некоторые интересные факты о фильме
1. Съемки картины происходили в Израиле (в Тель-Авиве, Иерусалиме, Мегиддо), США (Лос-Анджелес) и столицах Испании, Кении, Италии и Чили.
2. Фильм «Мегиддо: Код «Омега» 2» (2001) не является фактическим продолжением картины «Код «Омега» (1999), а, если можно так сказать, является альтернативным взглядом на тот же сюжет.
3. На протяжении всей картины ни разу не употребляется слово Иисус Христос. Его туманно называют «назаретянином».
4. В сценах, когда 21-летний Стоун Александр встречается с отцом в военном пансионе, он сантиметров на пять выше его. Но спустя десятилетия, Стоун почему-то становится намного ниже, сантиметров на пять ниже отца.
5. Есть в фильме еще одна тактическая ошибка. По закону президент и вице-президент США не имеют права лететь на одном и том же самолете.
Даты выхода фильма
7 сентября 2001 – США (премьера)
21 сентября 2001 – США
26 февраля 2002 – США (на видео)
30 июля 2002 – Филиппины
27 августа 2002 – США (на DVD)